Hoewel beide therapievormen zich richten op het verbeteren van lichamelijk functioneren, zijn er duidelijke verschillen. Oefentherapie is gericht op het bewust worden van je houding en beweging in alledaagse situaties. Het is een actieve therapievorm waarbij je leert hoe je zelf je klachten kunt verminderen en voorkomen door anders te bewegen en te handelen.
Fysiotherapie richt zich meer op het behandelen van specifieke klachten en aandoeningen van het bewegingsapparaat. De fysiotherapeut kan naast oefeningen ook gebruikmaken van massage, mobilisaties en andere behandeltechnieken.
Kortom, oefentherapie is vooral preventief en educatief van aard, terwijl fysiotherapie meer curatief en interventiegericht is.